Je to ošetřeno, lze kdykoliv zapsat, provede se zapsaný stav (a pokud je zrovna stejný, tak to zůstane jak je).
Takže klidně pořád dokola zapisovat stejnou hodnotu, to je zcela OK a bude to fungovat.

Ten #define je zjednodušení, není vůbec nutný. V základu se zapisuje přímo do sys[] pole, jen když se s tím někdo nechce vypisovat, nebo mít to přehlednější, tak si takto s tím define pomůže. Samozřejmě, pokud je pole indexováno proměnnou, tak už ten define nemá také smysl... ale to je zase jiná věc.

main {
    if (sys[231] != 0) {sys[231] = 0;};
    wait(100;)
}

Nebo je to v HW ošetřeno a můžu nastavit požadovaný stav přímo i když to bude několikrát za minutu?

main {
    sys[231] = 0;
    wait(100;)
}

Je potřeba dávat sys[index] do define? nebo to můžu používat přímo v kódu bez define?

#define RELE1 sys[231];